Kapal ini digunakan untuk penelitian (research) kelautan. Oleh sebab itu di dalam kapal dilengkapi dengan laboratorium untuk penelitian tentang biota laut, arus air, salinitas air laut dan sebaginya. Dalam bulan Mei 2009 kapal ini digunakan untuk penelitian di selat Makasar dan teluk Toli-toli.
Nama Baruna diambil dari nama Dewa dalam dongeng Jawa dan mytologi Hindhu yang berarti Dewa Laut (Varuna).
